陕西有8所大学入选第二轮双一流建设高校，其中就有空军军医大学，所以空军军医大学是双一流大学，不过只有1个双一流建设学科。
| 序号 | 双一流学科名称 |
| 1 | 临床医学 |
临床医学专业就业方向：主要在医疗卫生单位、医学科研等部门从事医疗及预防、医学科研等方面工作；在基层卫生院所从事常见病、多发病的医疗诊治工作，并能承担预防保健、卫生宣教和医学院校的辅助教学等各项工作。
| 序号 | 学校名称 | 学科名称 | 评估结果 |
| 1 | 空军军医大学 | 口腔医学 | A+ |
| 2 | 空军军医大学 | 生物学 | B+ |
| 3 | 空军军医大学 | 临床医学 | B+ |
| 4 | 空军军医大学 | 公共卫生与预防医学 | B+ |
| 5 | 空军军医大学 | 药学 | B+ |
| 6 | 空军军医大学 | 心理学 | B |
| 7 | 空军军医大学 | 生物医学工程 | B |
| 8 | 空军军医大学 | 基础医学 | B |
| 9 | 空军军医大学 | 中西医结合 | B- |
| 10 | 空军军医大学 | 护理学 | B- |
| 11 | 空军军医大学 | 中药学 | C+ |
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